Cílem rekonstrukce byla obnova původně navrženého prostorového konceptu vstupní haly a pantheonu v přízemí, patrových foyerů i výstavních sálů. Vstupní prostor muzea byl vyčištěn od příček a předělů a nově vydlážděn. Repasováno bylo vnitřní schodiště, pro které bylo nově vyrobeno monumentální zábradlí ve stylu art deco.

Byly opraveny vnitřní omítky a vybudovány rozvody vytápění a elektrického proudu. Slaboproudá i silnoproudá vedení byla umístěna do zdvojených podlah. Byly vyměněny všechny dveře a dřevěné prosklené stěny, oddělující požární úseky mezi výstavními sály a vstupními foyery. Z důvodu snížení energetické náročnosti byl zateplen střešní plášť budovy. Mezi složité práce patřila rekonstrukce kinosálu pro 120 diváků na multifunkční konferenční sál, který je vybaven moderním audio-video zařízením, ale také klasickým promítacím zařízením pro 35-ti milimetrové filmy.

Nově byl vybudován oddělený vstup pro pracovníky muzea, byl rekonstruován výtah a hygienické zázemí, modernizací prošla šatna i prostory prodejny. Současně byla celá budova upravena pro bezbariérový přístup a bylo vybudováno parkoviště pro 42 vozidel